测序这么做,向 SCI 迈进一大步!交大作者一次讲清应用重难点

2024-08-24 18:01 来源:微信公众号 - ShengWuXueBa 作者:生物学霸
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近日,上海交通大学余祥团队在 Nature Communications 发表最新研究,作者基于纳米孔 RNA 直接测序(DRS)开发出可迁移深度学习模型 TandemMod,能够在单个 DRS 数据中检测多种类型的 RNA 修饰。为动植物和微生物体内多种类型的 RNA 修饰位点鉴定及表观转录组研究提供技术支持[1]


纳米孔直接 RNA 测序的原理是什么?它的应用案例又有哪些?如何利用纳米孔测序技术冲击高质量文章?尤其在 RNA 修饰及表观遗传研究领域,如何利用纳米孔测序技术发现关键点?


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课程内容抢先看:



1

纳米孔测序原理及技术流程

2

纳米孔直接 RNA 测序的优势与选择

3

纳米孔测序技术助力揭秘多种 RNA 修饰

4

纳米孔测序在表观遗传领域中的应用案例


Oxford Nanopore 纳米孔测序是唯一可直接读取天然 RNA 转录本的技术,能够在没有 PCR 偏倚的情况下对基因和异构体表达进行定量。它还可提供全长异构体的分辨率,并准确估计 poly-A 尾长。此外,无需额外制备样本,可在单碱基分辨率水平直接测 DRACH 基序的 m6A 甲基化。更多应用详情,点击下方图片报名学习了解!

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内容策划:邹礼平

内容审核:李琳

题图来源:图虫创意


参考文献

[1]. Wu Y, Shao W, Yan M, et al. Transfer learning enables identification of multiple types of RNA modifications using nanopore direct RNA sequencing. Nat Commun. 2024 May 14;15(1):4049. doi: 10.1038/s41467-024-48437-4.


编辑: 王凯

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