IF 45 !中国科学院与哈佛新发现:携带该基因增加 10 倍血癌易感性

2024-07-29 18:03 来源:微信公众号 - ShengWuXueBa 作者:生物学霸
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前不久,中国科学院赵佳伟联合哈佛大学团队在 Cell 发表最新文章 [1]。研究结合全基因组测序和罕见突变体关联研究(RVAS),首次发现髓系恶性血液瘤易感性的重要家族风险基因:CTR9。携带该基因遗传突变,使血液肿瘤易感性增加 10 倍。


机制上,CTR9 作为 PAF1 蛋白复合体的关键组分,当发生部分突变时,可导致 PAF1 复合体解离形成新的超级延伸复合体(SEC),进而增强转录延伸与细胞的无限扩增,诱发血液瘤发生发展。该研究也首次揭示了 PAF1 复合体与 SEC 结合的相关蛋白可作为血液瘤治疗靶点。


来源:文献截图 [1]


近年来,越来越多血液瘤研究关注到与疾病相关的基因突变和变异。这些突变直接影响癌症的进展和治疗方法的选择,通过对基因表达及调控的机制探究,有助于理解疾病机理和开发靶向治疗策略,并为个性化治疗提供依据。


万事开头难!要准确地分析这些基因的表达和变异,最重要的一环是从血液和骨髓样本中提取高质量的 DNA 和 RNA。但目前传统的提取方法存在一定局限性,如:


样品不够新鲜 / 保存或处理不当容易导致核酸降解,得率低。

核酸分离与纯化方式欠佳导致大分子或离子等污染,降低核酸纯度。

尤其血液样本中细胞内核酸与游离核酸的分离直接影响核酸纯度。

提取步骤繁琐,样本量低等导致实验稳定性降低。


那么如何才能高效提取全血或骨髓样本中的核酸?可以考虑赛默飞最新研发的提取方式!能够从同一份样本中顺序提取 DNA 和 RNA,既节省了时间又充分利用样本,得率和纯度也毫不逊色。


自动化 DNA,RNA 顺序提取工作流程


1. 制备全血或骨髓样本,在 KingFisher 仪器上进行蛋白酶 K 消化。


2. 准备 DNA 裂解 / 结合和磁珠混合液,将其加入到每个样本中。


3. 在 KingFisher 仪器上继续 DNA 提取程序,获得纯化的 DNA。


4. 制备 RNA 结合和磁珠混合物,将其加入到先前的样本板中。


5. 设置 KingFisher 仪器程序并放置 RNA 提取所需板位。


6. 在仪器上 DNase 消化后添加 RNA 重结合溶液,继续剩下的提取流程,最终获得纯化的 RNA。




50/100 μL 样本量即可获得高质量核酸



1)不同体积、不同样本中的 DNA 提取性能测试


图 1. 不同起始量的骨髓和全血样本,所获 DNA 得率。


使用 100 μL 全血或 50 μL 骨髓可获得 > 200 ng DNA,同时扩展样本起始量可获得更高产量的高质量 DNA。


2)不同体积、不同样本中的 RNA 提取性能测试


图 2. 不同起始量的骨髓和全血样本,所获 RNA 得率。


从 100 μL 全血或 50 μL 骨髓中可获得 > 100 ng RNA,同时扩展样本起始量可获得更高产量的高质量 RNA。

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按照以上步骤,可以实现从血液和骨髓样本中顺序提取 DNA 和 RNA,该提取方法不仅高效、可靠,还能确保提取的 DNA 和 RNA 的高纯度和完整性。赛默飞核酸提取试剂盒 Applied Biosystems™ MagMAX™ Sequential DNA/RNA Kit,助你轻松应对每一次核酸提取。


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产品优势


顺序提取:该试剂盒能够同时提取 DNA 和 RNA,可以在一次实验中获得更为全面的分子信息,节省时间的同时充分利用样本资源。


高纯度产物:采用 Invitrogen™ Dynabeads™ 磁珠技术独特的纯化技术,确保实验结果的高度一致性和准确性。


灵活性强:满足小体积和大体积样本的提取需求。根据实验的具体要求进行扩展。


操作便捷:试剂盒采用简单的操作步骤,与 Thermo Scientific™ KingFisher™自动化核酸提取仪搭配适用,快速、轻松地进行样本处理,节省实验时间。


应用广泛:分离出的 DNA 和 RNA 洗脱液可用于广泛的分子应用,包括 qPCR 和测序等。在血液肿瘤的早期检测、治疗反应监测等相关领域,均能提供全方位的支持。


内容策划:沈佳钰

内容审核:吴军

题图来源:图虫创意


参考文献

[1]. Zhao J, Cato LD, Arora UP, et al. Inherited blood cancer predisposition through altered transcription elongation. Cell. 2024 Feb 1;187(3):642-658.e19. doi: 10.1016/j.cell.2023.12.016.

编辑: 王凯

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