出人意料,现在做 qPCR 也要「卷」!这不,导师提议举行一次「qPCR 最美曲线」评选大赛,实验群炸开了锅……

小师妹

我这熔解曲线又有杂峰,这不纯纯陪跑嘛!
一世英名毁于一旦,我的阴性质控扩增曲线有翘尾……


大师兄

师弟

看来我胜券在握!不枉我一番苦练啊!
厉害啊,师弟!还有隐藏技能,教教我们呗~


师姐

师弟

那当然,我可是做过功课的,课程也推荐给你们!
qPCR 可是科研人的必备技能,说起 qPCR 的实验经历,几乎人人都能吐槽两句。除了曲线杂乱无章,还有实验重复性差,对照设置错误等等……那么,出现这些问题的原因有哪些?如何解决? 数据如何分析?
不用担心,师弟推荐的宝藏课程来啦!天隆科技将于 6 月 6 日 14:00 开展线上专题课程《qPCR- 从实验流程到常见问题解析全攻略》,从实验流程、注意事项到数据分析解读,全方位剖析 qPCR 实验技巧,更有常见问题解析和案例分享,帮助大家实现技能进阶,得到理想数据!参与直播还有机会赢取手机支架、收纳包等 100 份精美好礼!
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一.常见问题解析
1. 熔解曲线出现杂峰:
1)杂峰在主峰之前,说明存在引物二聚体,建议需要重新设计引物。
2)杂峰在主峰之后,大多由非特异性扩增引起,建议调整稀释倍数、减少引物。
2. 扩增曲线抖动,不光滑或没有平台期
可能因为仪器不准或模板不纯。建议进行仪器校准;增大模板稀释倍数。
3. 实验重复性差
1)样本问题:每次实验尽量保证样品部位、处理条件的一致性,确保提取核酸的纯度。
2)技术问题:通过定期校准加样器、配制预混合液、去除气泡等规范实验操作。
二.实验设计中的对照设置
完整的 qPCR 实验设计应包括实验组(处理样本)、阳性对照组(野生型或参考样本)、阴性对照组、空白对照组。
其中,空白对照,即未添加模板的 qPCR 体系,用来验证 qPCR 体系是否受到污染。阴性对照,即添加阴性模板的 qPCR 体系,用于排除实验操作导致的假阴性。
三.数据处理(相对定量法)
1.目的基因 Ct 值的归一化:
ΔCt(实验组)= Ct(实验组的目的基因)-Ct(实验组的内参基因)
ΔCt(对照组)= Ct(对照组的目的基因)-Ct(对照组的内参基因)
2.实验组 ΔCt 的归一化:
ΔΔCt = 各样本的 ΔCt- 对照组的 ΔCt
3.表达水平的差异倍数:2 –ΔΔCt
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内容策划:潘成
内容审核:钟可可
题图来源:图虫创意