熬了 3 天 3 夜做完的 ChIP 实验,结果出来的一瞬间心碎了一地。

ChIP 实验的这些弊端无疑让 DNA 蛋白质互作研究变得低效,遇上珍贵的样本更是身心的折磨,让导师经费烧到心慌。到底该如何破解这种窘况?CUT&Tag®4.0 时代的到来,也许可以为正在苦恼的小伙伴们增加一点信心(图 1)。

图 1. ChIP 与 CUT&Tag 的比较
少细胞高兼容——CUT&Tag
CUT&Tag 技术的核心是在 Tn5 上融合了 protein AG 抗体结合功能域的转座体 pAG-Tn5。Tn5 可以包埋建库接头序列,具有「剪切 + 粘贴」的特性,在建库实验中大放异彩。可以在切割目的位点的同时,在目的片段两端添加建库接头,大大简化了建库流程,并且可兼容更低的起始细胞投入量(60 个细胞),融合的 Protein AG 也提高了对抗体的兼容性,使 DNA-蛋白质互作实验更加方便快捷。
CUT&Tag 技术可用于探索组蛋白修饰、转录因子结合蛋白等全基因组范围内 DNA-蛋白质的互作,具有广谱的适用性,在发育生物学、疾病发生机理、癌细胞研究、植物表观遗传学等研究方向贡献尤为突出。如您想详细了解 CUT&Tag®4.0 试剂盒,可识别下方二维码了解更多产品信息,还可享受买 3 送 1 的福利

近岸蛋白 CUT&Tag®4.0 试剂盒新品上线
产品亮点:
● 低丰度靶点研究无忧
近岸蛋白通过优化实验体系,开发可兼容高浓度甲醛交联 CUT&Tag 实验流程 fcCUT&Tag,不仅保留 CUT&Tag 对组蛋白修饰研究的良好效果,显著提高了转录因子、辅因子等低丰度位点实验成功率!
● 包含甲醛交联所需实验试剂,实验方案灵活度高
一套试剂盒兼顾了甲醛交联与非交联两种方案,可根据研究靶点,灵活选择对应方案。
● 添加 Spike-in 组分,有效矫正组间差异
实验样本间存在细胞数量的偏差,为了减少因细胞数量引起的实验样本间、批次间的生信分析的数据偏差,达到不同样本间生信数据相互标准化的目的,该试剂盒添加了外源 DNA 片段用于校准,使实验结果可比较。
● 优化扩增酶,保真性更高
定向优化文库扩增酶,保真性更高,结合转座酶的良好切割能力,使文库分布更均匀。
● 增加动植物组织处理方案
提供动植物组织实验处理参考方案,使有相关实验需求的科研 er 实验不再迷茫。
● 支持不同检测方法
CUT&Tag®4.0 试剂盒不仅兼容建库测序,还兼容 qPCR 检测,实验结果相互佐证,均可获得良好的实验结果。
实验数据展示:

图 2. CUT&Tag®4.0 产品交联与非交联测序数据结果展示
结果表明:对于转录因子而言,利用高浓度甲醛交联处理后,实验获得的 peak 数更多,背景更低,信噪比更高。

结果表明:对同一靶位点,不同细胞起始投入量进行 CUT&Tag 文库构建;在相同细胞种类与细胞量的投入量下进行 CUT&Tag 文库构建;在相同细胞数量不同种细胞系上进行 CUT&Tag 文库构建,近岸蛋白 CUT&Tag®4.0 试剂盒均能有较好的兼容性,且下机数据背景低,富集显著,信噪比高。

近岸蛋白 CUT&Tag®4.0 试剂盒买三赠一活动进行时
活动时间:即日起~2023 年 10 月 31 日
参与方式:点击「阅读原文」进行产品详情及价格
活动规则:1. 本活动全国终端用户参与;2. 本活动的最终解释权归苏州近岸蛋白质科技股份有限公司所有。
内容策划:王丹琦
内容审核:朱晓芳
题图来源:图虫创意
部分近岸蛋白 CUT&Tag 产品引用文献:
Hu, CL., Chen, BY., Li, Z. et al. (2022).Targeting UHRF1-SAP30-MXD4 axis for leukemia initiating cell eradication in myeloid leukemia. Cell Res. (IF: 46.297)
Zhang, Q., Zhao, Q., Li, T. et al. (2023). Lactobacillus plantarum-derived indole-3-lactic acid ameliorates colorectal tumorigenesis via epigenetic regulation of CD8+ T cell immunity. Cell metabolism. (IF: 29.1)
Jin, Y., Liu, Z., Li, Z. et al. (2022). Histone demethylase JMJD3 downregulation protects against aberrant force-induced osteoarthritis through epigenetic control of NR4A1. Int J Oral Sci. (IF: 24.897)
Chen, X., Wang, P., Qiu, H. et al. (2022). Integrative epigenomic and transcriptomic analysis reveals the requirement of JUNB for hematopoietic fate induction. Nature communications.. (IF: 17.694)
Song, K., Yang, X., An, G. et al. (2022). Targeting APLN/APJ restores blood-testis barrier and improves spermatogenesis in murine and human diabetic
models. Nature communications. (IF: 17.694)
Yin, X., Teng, X., Ma, T. et al. (2022). RUNX2 recruits the NuRD(MTA1)/CRL4B complex to promote breast cancer progression and bone metastasis. Cell Death Differ. (IF: 15.828)
Xu, J., Zhong, A., Zhang, S. et al. (2023). KMT2D Deficiency Promotes Myeloid Leukemias which Is Vulnerable to Ribosome Biogenesis Inhibition. Advanced science. (IF: 15.1)
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