
在做核酸琼脂糖凝胶电泳时,我们常遇到「条带模糊、没有条带、条带拖尾」等情况。
本文梳理核酸电泳「常见问题-可能原因-解决方法」,供大家参考!点击图片还可解锁标准实验 protocol,带你按照步骤一步步筛查实验问题。

「核酸电泳」
的 6 个决定因素
在了解了核酸电泳常见问题、关键步骤外,还有 6 个决定因素需注意:
1、琼脂糖:不同厂家、不同批号的琼脂糖,其杂质含量不同,影响 DNA 的迁移及荧光背景的强度,应有选择地使用。
2、凝胶的制备:凝胶中所加缓冲液应与电泳槽中的相一致,熔化的凝胶应及时倒入板中,避免倒入前凝固结块。倒入板中的凝胶应避免出现气泡,以免影响电泳结果。
3、电泳缓冲液:为保持电泳所需的离子强度和 pH,应经常更新电泳缓冲液。
4、样品加入量:一般情况下,0.5 cm 宽的梳子可加 0.5 μg 的 DNA 量,加样量的多少依据加样孔的大小及 DNA 片段的数量和大小而定。
当加样孔大时,样品上样量应相应加大,否则会造成条带浅甚至辨认不清;反之则应适当减少加样量,因为上样量过多会造成加样孔超载,从而导致拖尾或弥散,对于较大的 DNA 片段,此现象更明显。
5、DNA 样品:样本中盐浓度会影响 DNA 迁移率,平行对照样品应使用相同的缓冲条件以消除这种影响。
6、DNA 迁移率:取决于琼脂糖凝胶的浓度、迁移分子的形状及大小。采用不同浓度的凝胶有可能分辨范围广泛的 DNA 分子,制备琼脂糖凝胶可根据 DNA 分子的范围来决定凝胶的浓度。小片段 DNA 的检测应采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,以提高分辨率。
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