
PCR 条带拖尾、没条带、数据不稳定、出现引物二聚体,是 PCR 实验常见问题。
我们可以通过「PCR 反应体系」的调整,解决以上问题,包括调整:变性温度和时间、复性温度和时间、延伸温度和时间、循环数等参数。
如何优化 PCR 反应体系?
「进阶」
PCR 缓冲体系优化
除了 PCR 时间以及循环参数设置外,还可以通过优化缓冲体系,来得到稳定的实验数据。1、缓冲液标准的缓冲液含 10mM Tris·HCl , pH 为 8.3-9.0(室温),Mg2+ 浓度的高低会影响扩增的特异性和产率。缓冲液中还含有 50mM 的钾离子。有些缓冲液中还加入一些添加剂和共溶剂可降低错配率,提高富含 G+C 模板的扩增效率。2、脱氧核苷三磷酸(dNTP)
脱氧核苷三磷酸是 DNA 合成的底物,标准的 PCR 反应体系中含有等摩尔浓度的 4 种 dNTP ,即 dATP、dTTP、dCTP 和 dGTP ,终浓度一般为 200mM(即饱和浓度)。dNTP 的浓度会影响扩增的产量、特异性和忠实性。3、引物在多数试验中人们习惯使用的引物浓度为各 1mM ,即 1pmol/ml 。如果 5% 用于扩增 1kb 的 DNA 片段,可得到 3.3 μg 的产物,足以用于常规分析。引物设计一般要考虑以下几个问题:长度、引物的解链温度、避免引物内部或引物之间存在互补序列(3 个碱基),从而减少引物二聚体的形成以及引物内部二级结构的形成、G+C 含量等等。
以上就是 PCR 反应体系设置入门指南,欢迎收藏、转发,丁香实验做更优质的实验内容资讯离不开各位科研 er 的支持和关注!如果你是师兄师姐,也欢迎把本篇文章分享给师弟师妹们!
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