qPCR 曲线一团糟,可能一开始你就错了

2023-03-29 19:33 来源:微信公众号 - ShengWuXueBa 作者:生物学霸
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荧光定量 PCR(qPCR)是实验室常用的一种技术,该技术可以应用于基因表达分析、基因分型、病原体检测、SNP 分析等。qPCR 实验操作简单,原理易懂,但什么结果是理想的呢?今天教你学会如何看懂 qPCR 实验结果!


qPCR 数据分析的关键


qPCR 数据分析主要是利用 Cq 值进行计算,所以我们需要了解 qPCR 反应中几个重要的参数,根据参数的表现来进行实验评估。


扩增曲线:图 1 反映的是荧光信号变化量的对数与 qPCR 反应循环数的关系。图 2 反映的是随着 qPCR 反应的进行相应的荧光信号的变化,比较直观,但是指数期很短。标准的扩增曲线是呈现出「S」型,具有特征性的形状:首先背景信号,然后是三个增长阶段(指数增长期、线性增长期和平台期)。


图 1:扩增曲线对数图谱


图 2:扩增曲线线性图谱


基线:通常 3~15 个循环时,荧光信号变化不大,变化趋势接近于一条直线,即扩增曲线的水平部分,这样的直线就是基线。同一次反应中针对不同的基因需单独设置基线。


阈值:是荧光信号相对于基线有显著增强的点,大多数仪器会根据基线平均信号,自动计算荧光信号的阈值水平,并设置一个比平均值高 10 倍的阈值。手动设置是置于指数扩增期,刚好可以清楚地看到荧光信号明显增强。每次改变阈值时,要查看标准曲线的斜率和 R 的平方有没有改善。


Cq 值:qPCR 扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环次数,与起始浓度的对数成线性关系。分析定量时一般取 Cq:15~35,太大或者太小都会导致定量的不准确。


图 3:扩增曲线


熔解曲线:判断扩增的特异性,理想的熔解曲线具有锐利的单峰,证明 qPCR 实验中只可以检测到目的基因,引物特异性扩增靶序列,而没有扩增其他基因序列。


图 4:熔解曲线



GenStar qPCR 试剂特点


易检荧光强度高,易检测。

更高热启动 DNA 聚合酶,扩增效率更高,特异性更强。

更适灵敏度更高,适合低拷贝基因。

更稳重复性好,跨度均一产品性能稳定。

更低使用方便,性价比高,实验成本更低。



GenStar qPCR 试剂试用反馈结果展示


今天为大家精心挑选了部分有代表性的结果,我们一起来看看吧!



1. 细胞 cDNA





2. 酵母 cDNA





3. 鼠单核细胞株 cDNA





4. 质粒 DNA





5. 细胞




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内容审核:潘成
项目审核:钟可可

题图来源:图虫创意


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编辑: 王凯

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