屡做屡败?手把手教你 qPCR、测序、蛋白表达!

2023-02-06 19:02 来源:微信公众号 - ShengWuXueBa 作者:生物学霸
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新年伊始,又到了科研人员树立新目标的时候,回想 2022 年,养了 20 余笼小鼠、不下 100 盘细胞、更是做了成百上千次的核酸提取、qPCR、蛋白纯化、测序......

 

工作做的是不少,拿到的有效数据却少得可怜,其中有三类实验,最常出现问题,那就是:


师妹

师姐,蛋白表达不出来要怎么解决呢?

师姐,纯化过程中,蛋白出现了浑浊,怎么办呀?

师弟

师姐,NGS测序报告怎么解读,这么多数据哪个有用啊?

师弟

师姐,qPCR扩增曲线无法达到平台期是怎么回事啊?

师弟

师妹

师姐……

师姐

分子生物学实验过程多,容易出错,先跟你们说 3 点提升蛋白表达成功率的小技巧吧!


以下内容全部来自「TIANGEN 科研加油站」系列直播课程,将带你解锁蛋白表达「新姿势」,为你揭秘代谢组学及多组学领域的研究思路,还有「保姆级」反转定量实操教程,以及让科研更便捷高效的各种神器,直播现场还有好礼相送,快通过下方二维码提前预约吧,开播时会收到提醒哦!

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  3 步优化蛋白表达  

       方法一:编码优化       

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在开始蛋白表达之前,使用密码子优化算法,计算出合适的编码序列,并为其选择最合适的表达载体,从而能够大大提高蛋白的表达成功率,并且可以节省时间、精力和成本。

   方法二:搭配融合伴侣   

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可以尝试在重组蛋白中适当添加「蛋白质标签」,也就是一些短肽序列,这种方法可以有效提高蛋白的表达效率,然后再利用酶切技术或化学试剂去除标签即可。


 

 方法三:提升溶解液浓度 

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如果遇到蛋白表达量低,有可能时因为我们用来溶解蛋白的溶液浓度相对较低,这种时候,我们应当考虑适当提升溶解液的浓度。



通过以上 3 种方法可以在很大程度上提升蛋白表达的效率及成功率。同时,在实验操作的时候,需要多注意一些细节方面的问题,比如 pH 值、温度控制等等,细节决定成败,实验过程中更是要处处小心才行呢!


最近有一种新方法「CFS 无细胞蛋白表达系统」,可表达高至 360 kDa 的蛋白,实验步骤简单,无需密码子优化,不会形成包涵体,无需培养细胞,所需的表达时间也大大缩短至一天内,师妹也可以尝试一下!


说完了蛋白表达,再分享 3 个可以提高 qPCR 扩增效率的方法。



 3 步优化qPCR数据 

 方法一:反转录前 RNA 上样量要合适 

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RNA 上样量最好为 1 μg,最高不超过 2 μg,超过这个范围,会使反转录产物产生偏好性,也就是表达丰度高的基因会优先被反转录,而造成定量结果不准确。

   方法二:cDNA 模板浓度不需要测量   

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cDNA 是长短不一的 DNA 片段,由于反转录后体系中含有 dNTP 等物质,使得我们利用分光光度计测量浓度不准确;检测 cDNA 一般可以用内参基因做 PCR 扩增,如果内参有结果,cDNA 质量基本可以保证。

      方法三:设置合适的预变性时间      

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热启动酶原理不同启动时间各不相同,抗体修饰的酶启动时间短,化学修饰的酶启动时间长,热启动时间不正确会导致扩增效率下降,该如何设置预变性时间呢?建议大家仔细阅读试剂盒中的说明书,根据说明书的指示设置预变性时间。


科研之路总是充满坎坷,自己苦思冥想也难寻解决办法,想要提高自己的实验技术?知道的实验常见问题怎么解决?


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直播预告

直播主题

直播时间

蛋白表达“新姿势”

2月8日19:00

核酸提取“高效方案”

2月15日19:00

代谢组学及多组学研究思路

“全剖析”

2月21日19:00

“实验室助手”大揭秘

2月23日19:00

“保姆级”反转定量实验教程

2月28日19:00




直播现场还有多轮好礼相送

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 01 蛋白表达「新姿势」

传统蛋白表达步骤繁琐耗时长,对于膜蛋白和毒蛋白效果欠佳,是否有既可以缩短实验时间,蛋白表达效果又非常好的新技术呢?TIANGEN 直播间将带你解锁蛋白表达「新姿势」。

• 传统蛋白表达的方式和难点

• CFS无细胞蛋白表达系统的原理和特点

• CFS无细胞蛋白表达系统的产品和实验操作

• CFS无细胞蛋白表达系统的多种应用和结果展示


 02 核酸提取「高效方案」

核酸提取是分子实验的基础,方便实用的仪器会帮助我们更加高效稳定的完成实验,那我们应该如何选择呢,TIANGEN 直播间将为你带来核酸提取的「高效方案」。

• 常见样本前处理方法

• 低温均质仪特点

• 研磨成功案例分享

• 全自动核酸提取仪


 03 代谢组学及多组学研究思路「全剖析」

当下代谢组学研究都有哪些方案?代谢组数据如何分析,又能获得哪些结果呢?作为多组学的「黄金搭档」,代谢组学是如何联合其他组学对生物学问题进行深入探索的呢?本次直播将分享从原理到实践,代谢组学及多组学研究思路全剖析。

• 代谢组学原理及常见技术

• 代谢组学的数据挖掘方法

• 多组学研究思路及实际应用案例


 04 「实验室助手」大揭密

「工欲善其事,必先利其器」这句话同样适用在实验操作中,方便实用的仪器会让实验操作更加高效准确,那我们应该如何选择呢?TIANGEN 直播间将为你揭开「实验室小助手」的神秘面纱,敬请期待。

• 样本研磨小神器

• 离心机家族 TIANGEN 发展史

• 控温小能手的正确打开方式


 05 「保姆级」反转定量实验教程

反转定量实验现在已经是实验室常见技术,但是在实际上机操作的时候还是会遇到各种问题:为何 qPCR 复孔重复性差?为何目的基因CT值偏大?反转录上样量应该是多少呢?TIANGEN 直播间有一份「保姆级」反转定量实验教程等你来领取。

• 反转录实验详解

• 荧光定量实验详解

• 常见问题分析


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内容策划:那雪妍

内容审核:朱超敏

题图来源:图虫创意

编辑: 王凯

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