裂开!培养的细胞被毒死,投毒真凶原来是我自己

2022-11-10 18:02 来源:微信公众号 - ShengWuXueBa 作者:生物学霸
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最近,师妹养的细胞状态越来越差,就算复苏新的细胞种子,状态也依然好不了。一开始也以为是人为操作原因,但仔细讨论分析后才发现,原来是我们养细胞一直忽略的盲区所导致。


师兄,我新买的细胞因子,和你买的 Datasheet 参数差不多,但是内毒素指标不同,细胞状态就相差甚远,难道是它的原因?




要了解问题所在,首先我们得明白内毒素是什么?


内毒素(Endotoxin)是革兰氏阴性菌的细胞壁外壁层上的特有成分,主要由多糖、脂质和蛋白质组成复合体。只有当细菌死亡自溶或用人为破坏后才释放出来表现其毒性。内毒素直接作用于人体时,激活组织内的炎性细胞和炎症因子,导致机体发热并引发全身性炎症反应。


革兰氏阴性菌细胞壁结构,图片来源 DOI:10.1177/09680519010070030101



内毒素会影响重组蛋白的使用吗?


内毒素与细胞膜上的受体结合引起免疫反应,对细胞有较强的毒性作用,从而影响体内或体外细胞的生长和功能因此,在免疫学实验、细胞培养实验、细胞治疗、细胞凋亡研究以及干细胞培养与扩增分化中,使用的蛋白因子都要求低内毒素。在细胞因子功能分析、蛋白相互作用等研究中也必须使用低内毒素的重组蛋白以重组蛋白作为抗原,生产高质量的抗体更是需要低内毒素的重组蛋白


怎么挑选低内毒素的重组蛋白?



优质的重组蛋白在表达纯化过程中,特别注重水质要求,一般会使用注射级别用水,尽量减少内毒素的产生。此外,高通量亲和纯化系统,本身就是一种去除内毒素的理想方法。在蛋白纯化过程中,采用亲和层析过柱法,也能降低产品的内毒素含量。当然如果拥有 GMP 生产线,就能使得整个制备过程无菌,让重组蛋白的内毒素含量低于 0.01 EU/μg。


使用时,业内要求内毒素含量在体外细胞分化培养需 < 1 EU/μg,小鼠药效评价需 < 0.1 EU/μg。当然无论做哪类实验,重组蛋白的内毒素一定是越低越好!


成功挑选低内毒素的重组蛋白后,是否需要区分带有不种类标签的商品化重组蛋白,如果购买了带标签的蛋白,会影响后面的实验吗?



融合标签是指利用 DNA 体外重组技术,在目的蛋白 N 端或 C 端进行融合表达的特定蛋白、多肽或寡肽标签。通过融合标签与包被在固相基质上的特异配基结合,可以使重组蛋白定向固定并得以纯化,大大简化了重组蛋白的纯化。同时,它既保留了天然蛋白的大部分结构,又能实现增加溶解度、防止降解、促进分泌、便于纯化等功能。


重组蛋白的纯化一般分为标签蛋白纯化和无标签蛋白纯化,无标签蛋白纯化比较麻烦,一般需要根据蛋白质本身特定序列来选择多种纯化方法,只通过一种方法很难得到纯度较高的蛋白。虽然麻烦,但是无标签蛋白与天然蛋白有着相同的序列,更有利于蛋白结晶和蛋白功能研究。


较小的融合标签,免疫原性弱,对蛋白质的后续应用和研究不会产生影响。但是有些大标签是需要切除的,例如:Dsb 蛋白、FkpA 蛋白、GST 蛋白、SUMO 标签等。


主要融合标签的优缺点比较


融合标签

KDA

优势

劣势

His-tag

0.84

IMAC 填料成本较低,载体的广泛应用, 且有对标签的商业化抗体,标签尺寸小

特异性低,纯化纯度较低

FLAG

1.01

易剪切,有对应的抗体

亲和填料成本高

CBP

2.96

温度的洗脱条件

一些真核蛋白可能影响其与填料的结合

c-myc

12

易于检测

纯化成本高

ELP

9~36

无需填料纯化

需要筛选标签的类型和位点

HA

1.1

易于检测

纯化成本高

GST

26

促进表达,纯化成本较低

增溶能力一般

Strep II

1.06

特异性较好, 纯化成本相对较低

纯化成本比 IMAC 略高

MBP

42

促进表达、增溶

目的蛋白可能会影响其与填料的结合

Trx

12

促进表达、增溶

需要额外的亲和标签

NusA

55

促进表达、增溶

需要额外的亲和标签


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内容审核:邹礼平
项目审核:陆雯芸

题图来源:图虫创意


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编辑: 王凯

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