Nature 点赞的高潜技术!北大、中科院教授都在用它发文章

2022-11-04 18:05 来源:微信公众号 - ShengWuXueBa 作者:生物学霸
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空间生物学技术近年来发展迅速,为人们了解复杂组织提供了全面的视角,在 2020 年被《Nature Methods》评为「年度技术」。


今年 1 月,它又被《Nature》杂志评选为 2022 年 7 项值得关注的核心技术之一,并频繁出现在各大高分期刊封面上。




Nature Genetics封面文章


GeoMx 空间转录组技术详细解析胰腺癌新辅助治疗相关的多细胞动态变化[1]


Nature Medicine


DSP 空间多组学技术助力类风湿关节炎利妥昔单抗与托珠单抗治疗响应差异的分子机制解析[2]


Clinical Cancer Research封面文章


GeoMx 空间多组学技术帮助预测头颈癌免疫治疗响应的肿瘤相关成纤维细胞亚型及其作用机制[3]


Clinical Cancer Research 封面文章


GeoMx 空间多组学技术帮助预测头颈癌免疫治疗响应的肿瘤相关成纤维细胞亚型及其作用机制[4]


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随着空间生物学技术的科研发掘能力和临床应用价值被不断证实,这项技术也开始进入更多科研人视野,并引出不少大家感兴趣的问题:


空间组学究竟可以应用在哪些领域?

革命性空间原位检测技术带来哪些突破成果?

该技术如何助力基础科研和临床中的多领域应用?



为了将中国用户利用多靶标定量和空间多组学技术开展的研究成果、探究思路和项目进展分享给更多的广大科研工作者。NanoString Technologies 和冷泉港生物将于 2022 年 11 月 10 日 13:30 举办「NanoString 第六届大中华区用户交流会」线上会议。

NanoString 第六届大中华区用户交流会

聚焦空间组学技术在研究中的最新突破



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会议邀请国内开展空间组学应用的多领域科学家以及 NanoString 技术专家,共同探讨他们利用空间组学技术在转化医学研究中的最新突破以及探索和思考,聚焦空间组学在多疾病领域中的实际应用与研究进展。


作为空间生物学技术领域的一支重要领导力量,NanoString 的 GeoMx® DSP 平台在过去 3 年得到了全球科学家的认可和应用,显示出极具潜力的科研发掘能力和临床应用价值。NanoString 致力于为任何规模、任何阶段的多领域研究提供全面的空间生物学解决方案。除了会议主题涉及到的内容外,你还将了解到:


1、全转录组/蛋白质空间多组学平台 GeoMx® DSP


NanoString 的 GeoMx® Digital Spatial Profiler(DSP)空间多组学平台结合了组织影像分析和原位定量技术,可在展示全局组织结构的基础上,进一步实现从复杂组织中对细胞亚群或特定结构的精准分析。


在获得高分辨率的样本空间信息的同时实现高靶标蛋白(~ 150 种蛋白质)和全转录组(~ 20000 个基因)空间原位表达谱的精准获取。最新的 DSP 工作流程可以支持在一张组织切片上同时检测蛋白质和 RNA 的空间原位表达信息。


GeoMx® DSP 兼容多种组织样本类型(如 FFPE、新鲜冻存样本等),成为基础科研、转化医学研究和临床实践探究中强大有力的工具,使不同领域(如肿瘤学、免疫疾病、神经科学、药物研发等)的研究人员能够深入洞察组织微环境、功能亚结构、免疫系统作用机制和生物标志物发掘,满足不同阶段的研究和应用需求!


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2、nCounter®多靶标精准定量技术多领域应用


NanoString 的 nCounter® 数字荧光条码多靶标表达分析系统提供了一种简单、经济、高效的方法,能够以高灵敏度和高精确度同时对 800 个靶标进行定量检测分析。


无偏的数字化检测和多靶标分析可以兼顾数据质量和数量,为数百个靶标的研究提供了堪比金标准的灵敏度和可重复性。相比于 NGS 和基于 PCR 的表达检测方法, nCounter®  不需要 PCR 扩增、反转录和文库构建等可能导致结果偏差的扩增步骤。从样本到分析结果的整体工作流程仅需不到 1.5 天时间(包含 15 分钟总的手动操作时间)。


后续衔接免费的 nSolver 软件,可以实现快速、简单、直观的数据分析。该方案具备全面的样本兼容性,可支持的样本包括 Total RNA、FFPE、细胞裂解液、PBMC、血浆、血清等。目前基于  nCounter®  平台的定量技术已有超过 5,000 篇科研文献的发表。 nCounter®  快速、简便、高保真、高通量的特点,成为集 NGS 和 PCR-based 方法优势于一体的新一代表达检测方案。


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3、CosMx™ SMI 空间生物学技术创新:革命性空间原位检测技术


CosMx™ SMI 能够对组织切片中 1,000 多种 RNA 和 100 多种蛋白质分子进行单细胞和亚细胞水平的超高分辨率成像,其前所未有的分辨率可帮助研究人员实现精准透彻的生物学解析。


该项技术结合了超高分辨率成像技术和超高靶标检测能力,能够针对多种样本类型(如新鲜冷冻(FF)、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、类器官等)在单细胞和亚细胞分辨率上实现基因和蛋白质在组织原位的可视化展示和定量分析。


CosMx™ SMI 支持两种不同的工作模式,研究人员可以选择对多靶标进行组织成像,来开展探索和发现性研究;也可以选择高靶向性高检测通量模式,推进临床转化研究。两种模式之间可以灵活切换,为科学家提供适用于多种研究阶段的全流程方案。

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CosMx™ SMI 则着重在空间检测分辨率方面进行了突破性提升,可以实现对组织切片中上千种 RNA 和上百种蛋白质在单细胞和亚细胞水平的原位表达进行检测。GeoMx® DSP 和 CosMx™ SMI 共同为空间生物学的新发现和新突破,提供着前所未有的先进科技力量。



内容审核:那雪妍
项目审核:朱卿

题图来源:NanoString


参考文献:

[1]. Hwang, W.L., Jagadeesh, K.A., Guo, J.A. et al. Single-nucleus and spatial transcriptome profiling of pancreatic cancer identifies multicellular dynamics associated with neoadjuvant treatment. Nat Genet 54, 1178–1191 (2022). https://doi.org/10.1038/s41588-022-01134-8

[2]. Rivellese, F., Surace, A.E.A., Goldmann, K. et al. Rituximab versus tocilizumab in rheumatoid arthritis: synovial biopsy-based biomarker analysis of the phase 4 R4RA randomized trial. Nat Med 28, 1256–1268 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-01789-0

[3]. Obradovic A, Graves D, Korrer M, et al. Immunostimulatory Cancer-Associated Fibroblast Subpopulations Can Predict Immunotherapy Response in Head and Neck Cancer. Clin Cancer Res. 2022 May 13;28(10):2094-2109. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-21-3570. PMID: 35262677.

[4]. Natalie C. Fisher, Ryan M. Byrne, Holly Leslie, et al. Biological Misinterpretation of Transcriptional Signatures in Tumor Samples Can Unknowingly Undermine Mechanistic Understanding and Faithful Alignment with Preclinical Data. Clin Cancer Res (2022) 28 (18): 4056–4069. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-22-1102



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编辑: 王凯

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