
师妹

师兄!我的组会结果图被导师痛批一顿,求支招~
是我带你做的病毒蚀斑实验吗?哪一步出现了问题?


师兄

师妹

多孔板边上的孔总会有边缘阴影,拍了好多次都不行。
病毒蚀斑实验中,蚀斑的大小、分布、边缘情况都可以反应病毒生长和毒力因素。实验结果图模糊不清会导致实验结果不可信,这种错误可是会被拒稿的。


师兄

师妹

那这个实验要怎么优化呢?
先按照以下步骤规范实验操作,师兄再带你拍照。


师兄
病毒蚀斑实验是指当病毒感染细胞后,由于固体覆盖层的限制,释放的病毒只能从最初感染的细胞向周边扩展,经过几个周期的增殖,形成一个感染病变细胞聚集的区域,即为病毒蚀斑。蚀斑形态在不同的生长条件下和病毒种类之间存在显著不同。
蚀斑实验基本步骤
1. 宿主细胞的培养:将宿主细胞在多孔板中培养到汇合度 90% 以上。
2. 固体覆盖层的配制:可选用 0.6% 琼脂糖,2% 羧甲基纤维素(CMC)或 2.4% 胶体微晶纤维素(avicel)的水溶液,使用前应高压灭菌,室温密封保存。
3. 病毒的稀释与感染:将不同稀释倍数的病毒感染液与宿主细胞共培养,之后弃去病毒感染液,加入固体覆盖层继续培养。
4. 固定与染色:使用 10% 甲醛溶液进行固定,之后弃去固定液,用 0.5% 结晶紫溶液进行染色,待结晶紫充分自然渗透后,用水洗去浮色。
5. 拍照并计算分析:对染色后的多孔板进行拍照,计算每个孔中的蚀斑数,取相同稀释度重复样品的平均值计算病毒滴度。计算公式为:蚀斑形成单位(PFU/mL)= 平均蚀斑数/(稀释倍数 × 病毒感染液体积(mL))

图 1. 病毒蚀斑实验示意图
(上下滑动查看)
实验的最后一步——拍照也大有讲究,实验图像的质量高低决定着结果的真实性与论文质量,没有完美 Figure 图的论文如何入得了审稿人的「法眼」。

师妹

师兄,怎么才能把多孔板拍的清晰漂亮啊?
楼上新买了一台 Amersham ImageQuant 800,不仅可以拍多孔板,还能拍培养皿,拍出的图是彩色的、没有边缘阴影。除此以外,还可以用 IQTL 分析软件对拍照结果进行计数。


师兄

师妹

太方便了,师兄你快教教我。
操作流程都帮你整理好啦,一起看看吧!


师兄
Amersham ImageQuant 800 选配的 NP 透镜模块包括 NP 透镜和透镜导轨。
拍摄时,先将透镜导轨放置在透明样品盘中,再将多孔板放在导轨中心开口处,之后将透明样品盘放入下层样品仓,最后将 NP 透镜插入下层托盘并推到底。
在屏幕上,选择 Colorimetric 模式中的 OD measurement 进行拍摄即可。


图 2. NP 透镜成像

师妹

哇!灰色阴影果然不见了,这蚀斑结果图好漂亮!
别急,把图片在分析软件 IQTL 的 Colony Counter 中打开,还能让软件帮你计数呢!
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师兄

图 3. IQTL 的克隆计数功能界面
使用 IQTL 进行克隆计数的步骤具体如下:
1. 选择 Colony Counter 功能,在 Image 中打开需要分析的图片。
2. 在 Detect 中左键框选需要计数的区域,调整右侧灵敏度,斑点直径等滑块,直至想要计数的斑点绝大部分都被识别。
3. 在 Edit 中,使用 Draw 和 Delete,添加或删除图中计数的斑点,用 Split 分割连接在一起的斑点。
4. 在软件右上角读取计数和浓度分析结果。

师妹

太好用了!师兄,我悟了,那我做细胞克隆形成实验也可以用 Amersham ImageQuant 800 拍照,用 IQTL 软件分析了?
你太厉害了,都会举一反三了。这个仪器能够对多种样品类型进行成像,包括凝胶、印迹膜、多孔板和培养皿等。检测范围包括化学发光、荧光和白光成像。


师兄

Amersham ImageQuant 800 系统适合多用户环境,可对多种样品类型进行成像,包括多孔板和培养皿。专用配件,如 NP 透镜,帮助用户获得无边缘阴影效应的高质量成像结果。
此外,ImageQuantTM CONNECT 软件可远程访问图像库,并可预约空余机时;一体化高清触摸屏和外置 mini-PC,智能化设计,节省空间,灵活度更高。
如您对 Amersham ImageQuant 800 成像仪感兴趣,可以识别下方二维码或点击阅读原文下载成像仪详细资料,还可以申请机器试用!

内容策划:那雪妍
内容审核:周育红
题图来源:图虫创意
参考资料:
[1]. Mendoza, E. J., Manguiat, K., Wood, H., & Drebot, M. (2020). Two detailed plaque assay protocols for the quantification of infectious SARS-CoV-2. Current Protocols in Microbiology2020,57(1):cmpc105, doi: 10.1002/cpmc.105
[2]. Baer, A., Kehn-Hall, K. Viral Concentration Determination Through Plaque Assays: Using Traditional and Novel Overlay Systems. JoVE2014, (93), e52065, doi:10.3791/52065 .
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