PLOS ONE自2006年发展自今，每年逾万篇的发表论文数量，俨然成了学术期刊界的一条大鲇鱼，而且增长趋势不减。庞大的数量，每篇1350美元的发表费用，PLOS ONE的确赚得盆满钵盈。由于数量庞大，论文质量难免参差不齐，国内不少学者和研究单位对于PLOS ONE的评价也是褒贬不一。
现在把目光转向另外一个新创立的同样为开放获取的期刊——PeerJ。PeerJ由Peter Binfield(曾在PLOS ONE任职)和Jason Hoyt(曾为Mendeley的首席科学家)于2012年6月份正式创立。虽然同为开放获取期刊，但是PeerJ采用了完全不同的商业运行模式：每篇99美元的发表费用，或者选择终身付费发表，即一次性支付299美元便可以终身无限量地在PeerJ发表论文(感觉有点在做广告!!)。相比于PLOS ONE或者其他作者付费期刊，PeerJ的折扣更大、来势更猛。至于PeerJ之后发展状况如何，则需要时间来检验。
最近趁着PeerJ创刊伊始，我尝试着投了一篇有关红外相机监测的论文，后来被顺利接收。基于这次投稿经历，我想简单谈谈对PeerJ的一点体会。我利用R语言(R代码下载(3KB))提取了PeerJ已发表的前365篇论文(2013-02-12到2014-4-22)的基本信息，诸如投稿时间、接收时间、刊出时间、是否选择公开审稿过程和被引用次数等等，作一简单分析。
审稿速度。不得不承认，PeerJ的审稿速度非常快，从投稿至返回第一次审稿结果的平均中值为24天。我分别统计了该365篇论文在2013年及2014的接收时间(投稿到接收的天数)和刊出时间(接收到刊出的天数)，如下表所示：
公开审稿过程。我认为这一点是除了较低的发表费用外，PeerJ胜过PLOS ONE的另一大举措。PeerJ官网介绍超过80%的作者选择公开审稿过程，即读者可以浏览下载该论文从投稿、修改、编辑意见、审者意见和作者回复信等所有有关审稿过程的内容。
我同样分析了该365篇论文的是否公开审稿情况：总体为77%的作者选择公开审稿过程，其中2013年为75%，2014年为81%。看来，的确有更多的作者选择公开审稿过程。当然，除了编辑必须是实名外，将近43%的审者也选择了实名审稿。此处不得不提的是，对于类似我这样的学术新手，如何回复审者和编辑的审稿意见，PeerJ的公开审稿过程提供了大量的第一手学习资料！
编辑阵容。其实一个期刊的论文质量，很大程度上取决于编辑的阵容。PeerJ目前的845位编辑队伍，的确堪称豪华，其中亦不乏诸多诺贝尔得主。我好奇的是，PeerJ至今方才发表近370篇论文，其实绝大多数编辑根本没有审过一篇稿件。于是，我分析了这365篇论文的编辑(Academic Editor)，发现这365篇论文总共有190位编辑，占总编辑数的22%。看来，将近78%的编辑至今还没开工，而开工最多的编辑已经审理了17篇已发表论文。这190位已开始干活的编辑中，80%(152位)的编辑审理了1篇稿件，如下图所示：
影响因子。由于PeerJ自2013年才开始发表论文，所以还未曾有影响因子。不过，我通过提取每篇论文的被引用次数，或许可以一窥端倪。此处，为了更加保守估计论文的被引用情况，我直接采用PeerJ网站上的被引用次数，而不是Google Scholar中的数据，因为Google Scholar收录的期刊种类更多，包括许多非SCI期刊。结果发现，截止今日(2014-05-08)，该365篇论文的平均引用率为0.75，换言之，“影响因子”为0.75。其中，2013年论文的平均引用率为1.1，2014年为0.11。
当然，计算2014年的“影响因子”意义不大。虽然这是粗略的估计，但我感觉三四年以后，正式公布的影响因子应该会跟当年的PLOS ONE相似，至少有3分。因为随着时间推移，单篇论文被引用次数会越来越多。
学科分布。虽然PeerJ明确表示只接收生物科学和医学类的论文，但是在二级学科的分布上，有什么偏向吗？我获取了该365篇论文的学科分类信息，罗列了前20的学科类别。最多的为生态学(80篇)，占总论文数的21.92%，其次为进化生物学(51篇)和动物学(50篇)。排名前三的原来都是宏观生物学的学科，此时不知该高兴还是痛苦。高兴的是宏观方向稿源这么充足；痛苦的是，宏观方向的传统期刊太少了，影响因子也普遍太低了，所以估摸着就往PeerJ投稿来了。
PeerJ PrePrints。预印本文献库，想必大家并不陌生，比如最近吵得沸沸扬扬的“石头剪刀布”研究就是先发布在arXiv预印本网站上。PeerJ PrePrints也是一个预印本网站，且免费无限量投稿，而且最快会数小时内在线刊出。这也不得不说是PeerJ的一大创举。
"全程服务"。我自从投稿开始，到动物伦理审核，到最后刊出，编辑部一直有邮件跟作者保持联系，应该说PeerJ的投稿经历还是相当愉快的。最后稿子接收后，责任编辑Jackie Thai最后还帮忙修改了一些语法小错误，在此相当感谢。当然，如果想听听PeerJ有哪些优势，官方的介绍有一大堆，比如点这里，或这里。
美中不足。最后，对于PeerJ的投稿系统，虽然已经做得相当人性化，但熟悉了类似Scholar One的投稿系统后，刚开始还真是摸不着头脑，幸好在投稿过程中可以联系期刊编辑部帮忙。另外一点是，打开PeerJ的主页非常慢，上传几百KB的文件，都得至少五分钟。令人惊奇的是，文件多次上传失败后，PeerJ的首席执行官(CEO)Jason Hoyt立即发来邮件询问是否需要帮忙。难道Jason这家伙一直在后台监视着？当时，不知是因为国内对PeerJ网站进行了特殊呵护，还是PeerJ的主机跟不上，让投稿过程非常受折磨。后来我怀疑是PeerJ受到国内相关部门的呵护，因为当我最后甩出重磅炸弹，利用国外VPN(俗称fan-qiang)上传文件后，投稿过程则相当顺畅。此时，心想国内投稿还需要使用美国的IP，不免感慨良多。
总结：虽然感觉PeerJ有八分PLOS ONE的影子，当前的一些员工也多数来自或者曾在PLOS ONE工作，但是凭着更为大胆、创新的商业模式，PeerJ在未来几年应该能杀出另外一条道路，甚至有超过PLOS ONE的趋势。所以，对于刚开始的问题，"PeerJ，会是下一个PLOS ONE吗”？简单的回答是：青出于蓝而胜于蓝。