德国生物信息学家赢得DNA分析挑战赛百万美元大奖

2013-10-10 00:06 来源:生物360 作者:
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由生物信息学家 Daniel Huson 带领的团队赢得了 100 万美元奖金。

由美国国防部发起的一项 DNA 分析挑战比预期更为困难,但是赢家已经出现。上周,国防部宣布,Huson 队将会因其快速的 DNA 分析计算机程序获得 100 万美元奖金。今年早些时候,在 103 名参赛者中仅有3名脱颖而出进入决赛时,该比赛的设计和得分制度曾引来一些顶级竞赛者的严厉批评。

德国蒂宾根大学生物信息学家 Daniel Huson 的队伍进入了决赛,他称,他和队友对可能夺冠有“良好的感觉”。他们兴奋地发现,自己的感觉是对的。

这场官方名称为国防威胁降低局(DTRA)算法挑战赛的竞赛,试图寻求一个更好的方法来确认 DNA 样本中的组织和基因,以识别可能的生物恐怖威胁。该挑战赛对任何人都开放,参与者通过在线竞赛主持人 Inno Centive 提交其作品。Huson 称,他享受赢得竞赛所需要的疯狂而不间断的工作:“唯一一次像这样的工作,是我在塞雷拉基因公司研究人体基因组的时候。”

竞赛中,参与者需要在 9 组基因数据中获得一个及格的准确分数。一些人表达了对 DTRA 模糊的得分算法的不满,觉得自己不得不开发程序来满足一些并不明确的要求。

事实证明,该任务过于困难, DTRA 不得不延长截止日期并放松要求。这时,Huson 和他的两名同事——环境生命科学工程中心生物信息学家 Xie Chao 和蒂宾根大学的计算机科学研究生 Benjamin Buchfink ——才开始组队参加比赛。

“得分方式十分微妙。”Huson 承认,“确实有些事让人感到惊讶。”不过他表示,他的团队通过尝试许多不同的方法得以稳定发展。

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编辑: zhongguoxing

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