日前，2013年国家自然科学基金集中评审结果公布，其中医学科学领域336家科研机构共获得了419233.22 万元的资助金额。上海交通大学获得了 近 2.4 亿元的基金资助，排名第一。中大、复旦、华中科技大和北大分列二至五位。
医学科学部资助金额50强榜单如下：
| 排名 | 机构 | 医学科学部资助额(万元) | 总资助额（万元） | 所占比例 |
| 1 | 上海交通大学 | 23904.15 | 50570.75 | 47.27% |
| 2 | 中山大学 | 16799 | 31451.9 | 53.41% |
| 3 | 复旦大学 | 16041.7 | 34053.9 | 47.11% |
| 4 | 华中科技大学 | 13467.7 | 31280.96 | 43.05% |
| 5 | 北京大学 | 11765.5 | 42034.54 | 27.99% |
| 6 | 浙江大学 | 11457.2 | 44882.8 | 25.53% |
| 7 | 中国人民解放军第四军医大学 | 10935.7 | 13842.7 | 79.00% |
| 8 | 中国人民解放军第二军医大学 | 10818 | 12537 | 86.29% |
| 9 | 中南大学 | 10473.7 | 22583.7 | 46.38% |
| 10 | 中国人民解放军第三军医大学 | 10133 | 11832 | 85.64% |
| 11 | 南京医科大学 | 9820.5 | 10723.5 | 91.58% |
| 12 | 首都医科大学 | 9560.5 | 10758.5 | 88.86% |
| 13 | 四川大学 | 9525.35 | 20414.45 | 46.66% |
| 14 | 山东大学 | 8391.42 | 23289.89 | 36.03% |
| 15 | 南方医科大学 | 7244 | 8697 | 83.29% |
| 16 | 苏州大学 | 6701.25 | 16662.97 | 40.22% |
| 17 | 中国医科大学 | 6671 | 7428 | 89.81% |
| 18 | 同济大学 | 6629 | 23095.5 | 28.70% |
| 19 | 哈尔滨医科大学 | 5959 | 6986 | 85.30% |
| 20 | 武汉大学 | 5796 | 23820.05 | 24.33% |
| 21 | 重庆医科大学 | 5792 | 6263 | 92.48% |
| 22 | 天津医科大学 | 5685.65 | 6810.65 | 83.48% |
| 23 | 上海中医药大学 | 4761 | 4761 | 100.00% |
| 24 | 西安交通大学 | 4628.9 | 19676.4 | 23.53% |
| 25 | 安徽医科大学 | 4408 | 4543 | 97.03% |
| 26 | 中国人民解放军总医院 | 4159 | 4860 | 85.58% |
| 27 | 中国人民解放军军事医学科学院 | 3961 | 7482 | 52.94% |
| 28 | 广西医科大学 | 3890 | 4168 | 93.33% |
| 29 | 中国科学院上海生命科学研究院 | 3766.7 | 10997.2 | 34.25% |
| 30 | 吉林大学 | 3632 | 18315.63 | 19.83% |
| 31 | 厦门大学 | 3476 | 16653.4 | 20.87% |
| 32 | 新疆医科大学 | 3412 | 3721 | 91.70% |
| 33 | 广州中医药大学 | 3343 | 3411 | 98.01% |
| 34 | 北京中医药大学 | 3288 | 3429 | 95.89% |
| 35 | 温州医学院 | 3251 | 3962.2 | 82.05% |
| 36 | 南昌大学 | 3111 | 8172.5 | 38.07% |
| 37 | 南京大学 | 3016 | 24618.55 | 12.25% |
| 38 | 广州医科大学 | 2996 | 3098 | 96.71% |
| 39 | 郑州大学 | 2795 | 6684 | 41.82% |
| 40 | 成都中医药大学 | 2740 | 2765 | 99.10% |
| 41 | 昆明医科大学 | 2485 | 2614 | 95.07% |
| 42 | 南京中医药大学 | 2447 | 2467 | 99.19% |
| 43 | 大连医科大学 | 2406 | 2868 | 83.89% |
| 44 | 中国医学科学院 | 2388 | 2778 | 85.96% |
| 45 | 宁夏医科大学 | 2371 | 2727 | 86.95% |
| 46 | 暨南大学 | 2333 | 5431.5 | 42.95% |
| 47 | 中国药科大学 | 2320 | 2859 | 81.15% |
| 48 | 中国医学科学院北京协和医院 | 2116 | 2186 | 96.80% |
| 49 | 天津中医药大学 | 2095 | 2115 | 99.05% |
| 50 | 东南大学 | 2040.5 | 15156.6 | 13.46% |