同往年一样，8 月《The Scientist》杂志公布了2013年度最佳学术研究院的调查结果。 本榜单基于以下几个主题经加权平均后的排名：
1. 工作满意度（Job Satisfaction）
2. 同事（Peers）
3. 基础设施和环境(Infrastructure and Environment）
4. 研究资源Research Resources）
5. 薪酬（Pay）
6. 管理与政策（Management and Policies）
7. 教导与经验（Teaching and Mentoring）
8. 职位与升职期望（Tenure and Promotion）
For a full list of the Top 20 Institutions, including the strengths and weakness of each:
2. 同事（Peers）
3. 基础设施和环境(Infrastructure and Environment）
4. 研究资源Research Resources）
5. 薪酬（Pay）
6. 管理与政策（Management and Policies）
7. 教导与经验（Teaching and Mentoring）
8. 职位与升职期望（Tenure and Promotion）
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今年排名榜首的是拉霍亚过敏和免疫学研究所（La Jolla Institute for Allergy & Immunology, La Jolla, CA），这家机构去年还曾上榜最佳博士后工作场所（排名第二）。
第二位的美国血液系统研究所由去年的第八位上升至第二位，这家机构作为血液系统的子公司，能提供给科学家们安全的资金资助和真实反馈。
第三位的斯托瓦斯医学研究所则主要集合了先进设施致力于通过进行细胞基本生命过程的研究，寻求尖端技术更有效的预防和治疗疾病。
以下为入围研究所的部分研究成果（详细点击表中的链接）：
| 排名 | Best Places to Work Academia 2013 | 研究所相关研究论文成果 |
| 1 | 拉霍亚过敏和免疫学研究所 | |
| 2 | 血液系统研究所 | Biood Systems Research Institute |
| 3 | 斯托瓦斯医学研究所 | |
| 4 | 匹兹堡大学 | |
| 5 | 卡内基植物生物学科学研究院 | Carnegie Institution for Science, Department of Plant Biology |
| 6 | 圣犹大儿童研究医院 | |
| 7 | 福克斯蔡斯癌症中心 | |
| 8 | 斯克里普斯海洋学研究所 | Scripps Institution of Oceanography |
| 9 | ECRI研究所 | ECRI Institute |
| 10 | 俄克拉荷马州医学研究基金会 | Oklahoma Medical Research Foundation |
| 11 | 温安洛研究所 | |
| 12 | 斯坦福大学 | |
| 13 | 马萨诸塞州总医院 | |
| 14 | 系统生物学研究所 | |
| 15 | 罗斯威尔公园癌症研究所 | |
| 16 | 波士顿儿童医院 | |
| 17 | 布里格姆妇女医院 | |
| 18 | 北卡罗莱纳大学教堂山分校 | |
| 19 | 密歇根大学 | |
| 20 | 俄亥俄州立大学 | |