有幸连续两年都被邀请在系里硕士课程EPID745 Master Seminar上讲Endnote,第一次被邀请是因为导师的推荐,第二次被邀请是因为导师就是这门课的主讲。导师习惯用Reference Manager,不过现在她所有文献插入编辑的工作都由我们学生来做,所以她觉得我们应该更有“经验”,于是我就被推出来了。言归正传,基础的东西就不讲了,直接说技巧和心得吧:
1. 建立你自己的数据库:以前本科硕士的时候,也用Endnote,但是习惯于一个项目一个library,以至于最后想找什么还要到具体文件夹翻。我现在的导师就有一个master library(不过是reference manager格式的),文献在一个library里面统一管理,所有的paper文献插入编辑都可以用这一个数据库,很方便。不过,要注意的是,一定要避免重复插入文献,一定要留有备份,一定要确定自己用的数据库是最新的那个。Endnote里面可以建立子文件夹,这个更方便于管理。
2. 存储PDF:pdf的命名和存储路径很大程度决定了你文献管理的效率。命名我建议作者last name,year,journal的方式,如果想进一步说明,可以加个-之后加些备注,比如“review”,“diabetes”等等。很多人可能认为这样命名不好分类,其实,如果你的研究领域不是特别的广,如果你真的认真读了文献,这些不是问题。读文献的时候,以前我主要关注文章的内容,而不是特别关心文章的背景,比如作者谁牛不牛,组是哪里的,什么项目资助的等等。现在文献看多了,渐渐发现文献周边的东西我们也要了解,这样有助于记忆,也有助于对领域的了解。如果你对作者都熟了,自然一个last name就够了,可能分类就不太需要了。自然,这也不绝对,适当分一级文件夹也是可以的。Endnote里面有自动下载pdf的功能,不过如果你的endnote没有连到授权的数据库而只是公开的数据库,那么可能有一半左右的文章找不到全文(Endnote可以连自己的图书馆的,比如我们南卡的就有专门的授权可以用于endnote的链接,这个具体教程大家可以网上搜)。如果把pdf连到endnote里面,其实这样做很方便,但是有个问题,endnote存储pdf都是一个文献一个“文件夹”,你要想大批量分享你的pdf,你就很崩溃,因为都是一个个文件夹,每次要点进去才看到pdf。
3. 文章标注和记号:读文献是做科研最基本的工作,也是终生学习的最有效手段。文献量太大,如果不做适当的标注,很快就忘记,不论是你当时读得多精的文章。所以按照自己的习惯,在文章首页空白处做些记号,或者弄个笔记本做个索引,或者贴个便条纸,这些都能达到事半功倍的效果。
4. Endnote和reference manager(RM)的区别和联系:两个都是比较常用的文献管理,而且都是一个公司做的,endnote我觉得界面更友好,操作更简便,RM联网工作的能力是亮点。不过按照我的习惯,我更喜欢Endnote。界面简单,上手容易,版本更新快,可以自动搜原文,格式自定义修改都方便等等。
5. 把文献导入Endnote的方式有很多很多:比如最直接的是手动输入,不过这个要注意,作者名字怎么缩写,哪里加句号逗号,这些都能影响你的文献格式。其他导入方式可以有pubmed等数据库的搜索结果,比如pubmed,要保存成medline格式的text,然后在endnote按照相应格式导入就行。还可以从RM文件转出来导入。可以在Endnote软件里面直接搜索文献,搜索出来自动就导入了,不想导入的扔到垃圾箱里就行。我比较喜欢用google scholar(不过国内是不是上不了啊?),搜到文献,有个cite标签,点击之后就可以看到保存到endnote的标签,然后就可以导入了。
6. 编辑文献:文献不论来源是哪里,多少都存在一些格式问题,如果你在插入文献发现问题之后,一定要“第一时间”编辑更正,不要在word里面的reference list里面改,否则以后还会再费事。在word里,也可以右键点击文献插入的编号,然后选择编辑文献,这样在endnote里面就都改好了。
7. Word里面如何插入文献:最简单直接的就是在endnote里面选好要插入的,然后在word里面相应地方点击工具栏里endnote插入文献的命令就行了,这样不好的地方是每插入一次word会重新生成你的list。另外一个办法就是用{},在插入文献的地方用大括号,里面放上比如last name,year,或者title中的一些词,然后最后在统一生成文献列表。这样做的好处是不用总更新列表,还可以随时更改,还很清晰明了。尤其在论文打草稿阶段,这个方法最有效。
8. 自定义杂志格式:我们通常用endnote里面自带的杂志格式,但是由于软件版本多,很多版本的style,也就是杂志的格式不是最新的,应用的话会出错或产生麻烦。我的习惯是,在原有格式的基础上自定义自己想要的格式,然后保存。endnote格式自定义功能很强大,几乎所有的地方都可以自定义,包括字体,大小,段落,标点。有些带URL的,比如如何加accessed on date都可以定义。总之,你可以创建完全你想要的格式。
9. 永远都要留一个带code的版本:很多人习惯在论文提交前做一个没有code的版本(就是把所有插入的文献编号和列表都变成纯文本),这样可以随便编辑。不过,一定要留一个带code的版本,因为论文总是要改的,而且计划总没有变化快。等你要改的时候,如果不能连到endnote,那就崩溃了。
能想到的就这些了,希望对大家有帮助。这里再粘贴两个我讲课用的PPT,因为都是简短的介绍,而且很多时候要在软件里面演示,所以ppt内容可能不连贯不系统,大家有兴趣看看就好。Enjoy。