实验技术会多少才够用?

2017-02-20 18:22 来源:小张聊科研 作者:小张
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有的小伙伴说自己刚进实验室,看着各种高大上的技术一筹莫展,想怎么尽快入门,小张这里分享对于实验技术的几点粗浅理解。

首先呢,实验技术是我们解决问题的工具,而不是目的。就是说,咱们不能为了技术而技术,而是为了解决一定的科学问题而采用某些实验技术,比如,在上篇文章中,作者为了寻找缺氧敏感的 LncRNA 分子,并没有用转录组测序或者 LncRNA 芯片,而是直接从缺氧这一问题出发结合生物信息学预测的手段进行挑选的;再比如,为了研究 HIF-1α对 LincRNA-P21 的转录激活,用了 CHIP-PCR、荧光素酶报告基因实验来证明,当然这里还可以加一个凝胶迁移阻滞(EMSA)实验,这三个技术是研究转录因子调控靶基因的三个经典技术。

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当然,新的热门的技术有助于我们快速发表文章,比如在 LncRNA 刚刚兴起的时候,仅仅对某一疾病的样本进行表达谱检测就可以发一篇 2-3 分的文章,不过大家应该想的到,我们可以用这个技术,别人也可以,除非您的样本是稀有、独特的,比如研究的是熊猫的 LncRNA 表达谱,没有样本的小伙伴就只能干瞪眼了;还有就是拼钱、拼样本的模式,如果您是大佬,手里有几千万的经费和几千例样本,我等只能膜拜了。

其次呢,各种实验技术实在太多,而且每天都有新的技术出来,不过呢,对于我们做医学基础研究的朋友来说,个人粗略总结有四大入门技术:细胞培养、RT-PCR、Western Blot 和免疫组化,三大进阶技术:干扰/过表达、免疫沉淀和动物实验,这 7 个实验已经涵盖了分子、细胞、动物和临床四个层面了,大部分的文章用这些技术基本就可以解决了,其它的高级技术有很多都是这些技术的衍生技术。

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最后呢,把免疫沉淀 IP 单独拎出来说,我们发现好多高分文章特别喜欢用 IP 或者 IP 衍生出来的技术,原因也很简单,因为高分文章对机制研究的要求比较高,只用 Western Blot 或者 RT-PCR 是不能证明两个分子之间的直接结合的,而免疫沉淀是证明两个分子结合的最经典办法,比如蛋白和蛋白之间用免疫共沉淀+酵母双杂交+GST Pull down,蛋白和 RNA 之间用 RNA Pulldown+ RIP(RNA Immunoprecipitation),蛋白与 DNA 之间用 CHIP(Chromatin immunoprecipitation)+EMSA 等。所以,给小伙伴们出个主意,如果想冲击高分文章,可以尝试从某些明星分子出发,做下 IP,说不定会有惊喜哦!

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最后预告下,我们下期为大家分享的一篇用 IP 技术研究 LncRNA-蛋白-DNA 之间调控关系的文章,我们会细化看看 IP 技术在高分文章研究中的广泛应用,文章题目:

Zhang A, Zhao JC, Kim J, Fong KW, Yang YA, Chakravarti D, Mo YY, Yu J.LncRNA HOTAIR Enhances the Androgen-Receptor-Mediated Transcriptional Program and Drives Castration-Resistant Prostate Cancer.Cell Rep. 2015 Oct 6;13(1):209-21.

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编辑: 齐梦霞

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