本文转载自微信公众号「crabyter 科研宝」(ID:crabyter_kyb)。
临床科研离不开「数据采集」,过去临床医生总是为了得到高质量的数据而发愁,虽然数据的来源有很多,比如 HIS 系统,医院信息科、自己平时积累的数据等,但是传统的数据采集方式仍然给临床医生带来很多不便。
临床数据采集的传统来源有哪些?
临床医生大部分以做回顾性研究为主,主要都是需要写课题时才去搜索相应的患者病历信息,一般有以下途径:
①医院 HIS、LIS 系统的信息
②病案室里的档案和文件
③医院信息科采集的数据
④自己平时保存的纸质病历、excel 等
⑤科室其他成员的数据
传统数据采集的「痛点」在哪?
想拿数据真的很难
数据来源看起来很多,HIS 系统、医院信息科电脑里都有,但实际操作中要拿到这些数据非常难。比如 HIS 系统,出于数据安全性和隐私性的考虑,医院都不会轻易的让医生去接触这些数据,医生如果做课题想查找某一类患者数据,还要层层批准。
很多医生就去找医院里的信息科帮忙,关系相处得好的还行,如果不认识人的想得到数据好比登天。很多医院信息科人员都是不愿承担风险的,所以会百般阻挠临床医生获得数据。至于病案室里的文件,虽然总是堆得满满,但很少有人问津,因为真的太苦太累,很少有人愿意用这种方式采集数据。
到最后,只有自己保存的 excel 的患者病历可以用,运气好的话可以要来其他医生的数据一起做研究,但这些数据做回顾性研究都不全面。
肉眼式检索
传统数据采集方式的检索很麻烦!过去的数据库不发达,很多数据来源依靠临床医生归档的纸质病历:当需要查找某种疾病的患者数据时,只能靠肉眼搜索的方式去翻找,由于非常耗时间,许多医生就把这种苦活累活交给实习生或助理去弄,但这样的搜索质量很差。
现在虽然有了 HIS 系统,但很多临床医生反馈数据检索仍然很烦。医院 HIS 系统的主要作用是医院科室管理,不是专为临床科研去设计的,所以患者数据的字段格式很僵硬,录入也不够灵活。就算医生花大量时间把病历信息输入 HIS 系统,但系统搜索功能仍然落伍,当我们需要作回顾性研究时,只能从 HIS 中把一个一个患者的病历导出来,输入自己 excel 表格里,最后还是要靠肉眼检索。
无法快速地统计分析
临床数据必须经过统计学处理,才能得到需要的科研结果。临床医生的工作很忙,总是希望用最少的时间解决统计分析过程。但实际上,传统方式采集到的数据都无法直接拿来做统计,而是要经过反复的数据再处理、再校验、再核对……,然后才能拿去 SPSS、SAS 等统计网站上分析。
比如把 HIS 系统数据导成的 excel,个个字段的格式未必符合统计软件的要求,需要对字段的顺序和属性进行调整;至于其他来源(纸质病历、其他人的 excel 等)的数据格式很杂更乱,要花好一番功夫清理数据后才能统计分析。
数据来源之间毫无对接
传统数据来源还有一个痛点:互相之间无法数据对接。数据来源纵然多,但是他们的格式和标准都不一样:有些患者信息用了文本式记载、有些是 excel 表格、或图片照片,这些数据之间无法匹配
各个医院的 HIS 系统字段可能都不一样,各个医生自己做的 excel 格式也都不一样,当我们从各个渠道采集来大量数据,最后发现把这些数据整合在一起是多么的困难!
数据采集永远是临床科研中最重要、最头疼的环节,究竟如何克服这些痛点得到高质量的数据呢?如何不拘泥于传统的数据采集来源,高效完成临床科研呢?敬请期待下期。