编者按:论文遭撤稿的原因众多,但一次牵出 10 大撤稿理由的,要数清华大学医学院的这篇文章了。
PLOS One 杂志最近撤销了来自清华大学医学院的一篇论文,并列举了文章的 10 个撤稿理由。
「Metagenomic Human Repiratory Air in a Hospital Environment」是论述利用基因测序技术扫描医院内存在的病原体的论文,通讯作者为 Geng Tian(第一作者 Yi Yu Lai),均来自清华大学医学院基因组学和合成生物学中心。
这篇文章让加州大学的微生物学家 Jonathan Eisen 在 Pubmed 和 PLOS One上都忍不住吐槽,这10条理由其中的任何一条都足以让文章撤稿,以下为撤稿说明的详细解释:
1. 拼写错误:文章语言未达到发布要求。编辑部审查时就告知作者需要对文章语言进行修改,但直到终稿发布作者也没有任何回应和修改。
文中拼写错误比比皆是:首先,标题中的「Repiratory」应该是「Respiratory」;其次,文中出现「postion」,「microorgnisms」,「maliganant」,「leathal」及「noncosomicol」等词汇拼写错误,在同一句话中还出现「Petri dish」和「petridish」。
2. 名词解释抄袭:论文中的「Hospital-acquired infection」部分和 wiki 百科上内容部分高度重合。
(Wiki 上的解释)
(被撤论文有关 Hospital-acquired infection 说明部分)
3. 论文表 一内容是抄袭自文章 Julia S. Garner: Guidelines for Isolation Precautions in Hospitals Hospital Infection Control Advisory Committee 01/01/1996 。
(Guidelines for Isolation Precautions in Hospitals Hospital Infection Control Advisory Committee 图表截图)
(被撤论文图表一)
4. 论文中表二改编自文章 Pasanen, A.L., A review: Fungal exposure assessment in indoor environments. Indoor Air, 2001. 11(2): p. 87–98。
(A review: Fungal exposure assessment in indoor environments. 的图表)
(被撤论文图表二)
5. 引用数据未注明来源 :文中 87.7% 的 MG-RAST 测序未注明引用来源。
6. 样本不足:文中病原体样本检测的证据不足。
7. 无论是采取生物信息学方法还是 PCR 等独立方法获得的MG-RAST 数据均无效,此外,论文中有关类群的潜在非特异性匹配结论也表述不清楚。
8. 按照现有确定的基因组学分组,大量的宏基因组应该按照 CFU/mL 数量级进行比较。文中只字未提如何计算确认琼脂培养板上的不同物种,也未提及文献准备和宏基因测序中规范数据的信息。
9. 文章未说明 PhiX174 来源的结果是来自文献准备还是试验污染。人类逆转录病毒已会读取人类基因组,但文章相关内容并未澄清。
10. 论文图表 e7 中宏基因读取作业的数据不准确,列出的几类细菌也不应当被列为病原体。
文章刊登于 2015 年 10 月,按照 SCI 的统计尚未被引用。Eisen 教授发现了这篇文章的问题,并且很快向 Retraction notes 联系:「当我第一次指出文章的错误时,仅仅是因为它的引用未注明来源,但没有想到的是,这仅仅是个开始」
文章正式发布两周后,PLOS 刊出文章的相关说明:「有读者已经注意到文章存在的众多问题,编辑部也早已获悉,目前正在积极寻求解决办法。」
截止到发稿,Retraction Watch也并未有最新作者回应。
除震惊之余,我们不禁要问三问:
为何在中国撤稿事件屡见不鲜?
为何文章该严谨清晰处理却连拼写错误都遍布全文?
为何文章会被PLOS One接受并在诸多质疑下仍旧发表出来?