国家科学技术奖是我国科学技术领域的最高奖，分为国家最高科学技术奖、国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科学技术进步奖和中华人民共和国国际科学技术合作奖五个奖项。其中，国家科学技术进步奖授予在技术研究、技术开发、技术创新、推广应用先进科学技术成果、促进高新技术产业化，以及完成重大科学技术工程、计划等过程中做出创造性贡献的中国公民和组织。中国校友会网大学研究团队专家、桂林电子科技大学王凌峰副教授指出，中国校友会网2013中国大学科技进步奖排行榜以2000-2011年我国高校作为第一完成单位获得的国家科技进步奖(通用项目)二等奖以上奖励为数据基础统计得出，是衡量高校技术创新贡献力的重要尺度，是反映2000年以来我国高校应用研究和成果转化水平的重大标志。
报告显示，2000年以来，中国科学院大学（简称国科大）获国家科技进步奖奖励数量最多，有114项，雄居中国校友会网2013中国大学科技进步奖排行榜榜首，是2000年以来我国自然科学领域技术创新贡献力最强、应用研究与成果转化水平最高的高校。上海交通大学40项，位居第二；浙江大学有36项，名列第三；清华大学有30项，居第四名；北京协和医学院获28项，位居第五；华中科技大学有24项，名列第六；中南大学有23项获奖，居第七；武汉大学和中国农业大学各有19项，并列第八；西安交通大学有18项，位居第十。其中，按照中国科学院大学官方的介绍，将中科院各院所的科学成果等统一按中国科学院大学进行统计。
位居"中国校友会网2013中国大学科技进步奖排行榜"前二十的其他高校依次是天津大学、北京大学、哈尔滨工业大学、中国矿业大学、首都医科大学、复旦大学、湖南大学、华东理工大学、重庆大学和北京航空航天大学等。其中，2012年新成立的中国科学院大学（简称国科大）作为第一完成单位获5项国家科技进步奖一等奖，居全国大学首位；中南大学获3项一等奖，居第二；清华大学和北京航空航天大学各获2项目，并列第三。另外北京协和医学院、中国农业大学、复旦大学、湖南大学、四川大学、同济大学、南京农业大学、西南交通大学、南京工业大学、长沙理工大学和成都理工大学各获一项国家科技进步一等奖。
中国校友会网2013中国大学科技进步奖排行榜25强
| 名次 | 学校名称 | 所在地区 | 类型 | 2013大学排名 | 一等奖 | 二等奖 | 合计 |
| 1 | 中国科学院大学 | 北京 | 理工 | - | 5 | 109 | 114 |
| 2 | 上海交通大学 | 上海 | 综合 | 5 | 0 | 40 | 40 |
| 3 | 浙江大学 | 浙江 | 综合 | 4 | 0 | 36 | 36 |
| 4 | 清华大学 | 北京 | 理工 | 2 | 2 | 28 | 30 |
| 5 | 北京协和医学院 | 北京 | 医药 | 36 | 1 | 27 | 28 |
| 6 | 华中科技大学 | 湖北 | 理工 | 11 | 0 | 24 | 24 |
| 7 | 中南大学 | 湖南 | 综合 | 19 | 3 | 20 | 23 |
| 8 | 武汉大学 | 湖北 | 综合 | 9 | 0 | 19 | 19 |
| 中国农业大学 | 北京 | 农林 | 28 | 1 | 18 | 19 | |
| 10 | 西安交通大学 | 陕西 | 综合 | 18 | 0 | 18 | 18 |
| 11 | 天津大学 | 天津 | 理工 | 23 | 0 | 17 | 17 |
| 12 | 北京大学 | 北京 | 综合 | 1 | 0 | 14 | 14 |
| 复旦大学 | 上海 | 综合 | 3 | 1 | 13 | 14 | |
| 哈尔滨工业大学 | 黑龙江 | 理工 | 17 | 0 | 14 | 14 | |
| 湖南大学 | 湖南 | 综合 | 29 | 1 | 13 | 14 | |
| 中国矿业大学 | 江苏/北京 | 理工 | 43 | 0 | 14 | 14 | |
| 首都医科大学 | 北京 | 医药 | 78 | 0 | 14 | 14 | |
| 18 | 华东理工大学 | 上海 | 理工 | 35 | 0 | 13 | 13 |
| 19 | 北京航空航天大学 | 北京 | 理工 | 24 | 2 | 10 | 12 |
| 重庆大学 | 重庆 | 综合 | 31 | 0 | 12 | 12 | |
| 21 | 中山大学 | 广东 | 综合 | 7 | 0 | 11 | 11 |
| 吉林大学 | 吉林 | 综合 | 8 | 0 | 11 | 11 | |
| 中国石油大学 | 山东/北京 | 理工 | 55 | 0 | 11 | 11 | |
| 北京林业大学 | 北京 | 林业 | 72 | 0 | 11 | 11 | |
| 25 | 四川大学 | 四川 | 综合 | 13 | 1 | 9 | 10 |
| 山东大学 | 山东 | 综合 | 15 | 0 | 10 | 10 | |
| 东华大学 | 上海 | 理工 | 47 | 0 | 10 | 10 |