| 序号 | 编号 | 项目名称 | 主要完成人 | 推荐单位/ 推荐专家 | |
| 1 | Z-101-2-01 | 模空间退化和向量丛的稳定性 | 孙笑涛(中国科学院数学与系统科学研究院) | 中国科学院 | |
| 2 | Z-101-2-02 | 大维随机矩阵理论及其应用 | 白志东(东北师范大学) | 吉林省 | |
| 3 | Z-101-2-03 | 守恒律组和玻尔兹曼方程的一些数学理论 | 杨 彤(香港城市大学) | 周毓麟，李大潜，石钟慈 | |
| 4 | Z-102-2-01 | 低维强关联电子系统中的奇异自旋性质理论研究 | 王玉鹏(中国科学院物理研究所)， 曹俊鹏(中国科学院物理研究所)， 张 平(北京应用物理与计算数学研究所)， 陈 澍(中国科学院物理研究所)， 戴建辉(浙江大学) | 中国科学院 | |
| 5 | Z-102-2-02 | 金笼子与外场下纳米结构转变的研究 | 龚新高(复旦大学)， 孙得彦(中国科学院固体物理研究所)， 刘志锋(香港中文大学)， 顾 晓(复旦大学)， 季 敏(复旦大学) | 教育部 | |
| 6 | Z-102-2-03 | 基于核自旋的量子计算研究 | 杜江峰(中国科学技术大学) | 教育部 | |
| 7 | Z-102-2-04 | “高能电子宇宙射线能谱超出”的发现 | 常 进(中国科学院紫金山天文台) | 中国科学院 | |
| 8 | Z-103-2-01 | 基于边臂策略的立体化学控制与催化反应研究 | 唐 勇(中国科学院上海有机化学研究所)， 孙秀丽(中国科学院上海有机化学研究所)， 叶 松(中国科学院上海有机化学研究所)， 周 剑(中国科学院上海有机化学研究所)， 康彦彪(中国科学院上海有机化学研究所) | 上海市 | |
| 9 | Z-103-2-02 | 特定结构无机多孔晶体的设计与合成 | 于吉红(吉林大学)， 庞文琴(吉林大学)， 李激扬(吉林大学)， 李 乙(吉林大学)， 徐如人(吉林大学) | 教育部 | |
| 10 | Z-103-2-03 | 含氮手性催化剂的设计合成及其不对称催化有机反应研究 | 冯小明(四川大学)， 刘小华(四川大学)， 林丽丽(四川大学) | 教育部 | |
| 11 | Z-103-2-04 | 纳米材料的安全性研究 | 赵宇亮(中国科学院高能物理研究所)， 陈春英(国家纳米科学中心)， 王海芳(北京大学)， 丰伟悦(中国科学院高能物理研究所)， 柴之芳(中国科学院高能物理研究所) | 中国科学院 | |
| 12 | Z-103-2-05 | 基于天然高分子的环境友好功能材料构建及其构效关系 | 张俐娜(武汉大学)， 杜予民(武汉大学)， 蔡 杰(武汉大学)， 陈凌云(武汉大学)， 周金平(武汉大学) | 湖北省 | |
| 13 | Z-103-2-06 | 复杂生物样品的高效分离与表征 | 邹汉法(中国科学院大连化学物理研究所)， 张丽华(中国科学院大连化学物理研究所)， 叶明亮(中国科学院大连化学物理研究所)， 吴仁安(中国科学院大连化学物理研究所)， 张玉奎(中国科学院大连化学物理研究所) | 辽宁省 | |
| 14 | Z-103-2-07 | 金属酶的化学模拟及其构效关系研究 | 毛宗万(中山大学)， 计亮年(中山大学)， 巢 晖(中山大学)， 刘建忠(中山大学)， 鲁统部(中山大学) | 广东省 | |
| 15 | Z-104-2-01 | 黄土和粉尘等气溶胶的理化特征、形成过程与气候环境变化 | 安芷生(中国科学院地球环境研究所)， 张小曳(中国科学院地球环境研究所)， 曹军骥(中国科学院地球环境研究所)， 李顺诚(香港理工大学)， 刘晓东(中国科学院地球环境研究所) | 中国科学院 | |
| 16 | Z-104-2-02 | 中亚增生造山作用及其环境效应 | 肖文交(中国科学院地质与地球物理研究所)， 孙继敏(中国科学院地质与地球物理研究所)， 高 俊(中国科学院地质与地球物理研究所) | 中国科学院 | |
| 17 | Z-104-2-03 | 中国大气污染物气溶胶的形成机制及其对城市空气质量的影响 | 庄国顺(复旦大学)， 郭志刚(复旦大学)， 黄 侃(复旦大学)， 孙业乐(复旦大学)， 王 瑛(复旦大学) | 上海市 | |
| 18 | Z-104-2-04 | 过去2000年中国气候变化研究 | 葛全胜(中国科学院地理科学与资源研究所)， 王绍武(北京大学)， 邵雪梅(中国科学院地理科学与资源研究所)， 郑景云(中国科学院地理科学与资源研究所)， 杨 保(中国科学院寒区旱区环境与工程研究所) | 中国科学院 | |
| 19 | Z-105-2-01 | 水稻复杂数量性状的分子遗传调控机理 | 林鸿宣(中国科学院上海生命科学研究院)， 高继平(中国科学院上海生命科学研究院)， 任仲海(中国科学院上海生命科学研究院)， 宋献军(中国科学院上海生命科学研究院)， 金 健(中国科学院上海生命科学研究院) | 上海市 | |
| 20 | Z-105-2-02 | 年轻新基因起源和遗传进化的机制研究 | 王 文(中国科学院昆明动物研究所)， 杨 爽(中国科学院昆明动物研究所)， 周 琦(中国科学院昆明动物研究所)， 蔡 晶(中国科学院昆明动物研究所)， 李 昕(中国科学院昆明动物研究所) | 云南省 | |
| 21 | Z-105-2-03 | 脊椎动物免疫的起源与演化研究 | 徐安龙(中山大学)， 黄盛丰(中山大学)， 元少春(中山大学)， 陈尚武(中山大学)， 禹艳红(中山大学) | 教育部 | |
| 22 | Z-105-2-04 | 植物应答干旱胁迫的气孔调节机制 | 宋纯鹏(河南大学)， 张 骁(河南大学)， 苗雨晨(河南大学)， 江 静(河南大学)， 安国勇(河南大学) | 河南省 | |
| 23 | Z-105-2-05 | 纳米材料若干新功能的发现及应用 | 阎锡蕴(中国科学院生物物理研究所)， 梁 伟(中国科学院生物物理研究所)， 汪尔康(中国科学院长春应用化学研究所)， 顾 宁(东南大学)， 杨东玲(中国科学院生物物理研究所) | 北京市 | |
| 24 | Z-105-2-06 | 凹耳蛙声通讯行为与听觉基础研究 | 沈钧贤(中国科学院生物物理研究所)， 徐智敏(中国科学院生物物理研究所)， 余祖林(中国科学院生物物理研究所) | 中国科学院 | |
| 25 | Z-106-2-01 | 中药复杂体系活性成分系统分析方法及其在质量标准中的应用研究 | 果德安(北京大学、中国科学院上海药物研究所)， 叶 敏(北京大学)， 吴婉莹(中国科学院上海药物研究所)， 关树宏(中国科学院上海药物研究所)， 刘 璇(中国科学院上海药物研究所) | 国家中医药管理局 | |
| 26 | Z-106-2-02 | TGF-β/Smad信号通路维持组织稳态的生理功能和机制 | 杨 晓(中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所)， 滕 艳(中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所)， 王 剑(中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所)， 兰 雨(中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所)， 孙 强(中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所) | 北京市 | |
| 27 | Z-106-2-03 | 小檗碱纠正高血脂的分子机理，化学基础及临床特点 | 蒋建东(中国医学科学院医药生物技术研究所)， 宋丹青(中国医学科学院医药生物技术研究所)， 魏 敬(南京医科大学南京第一医院)， 孔维佳(中国医学科学院医药生物技术研究所)， 潘淮宁(南京医科大学南京第一医院) | 卫生部 | |
| 28 | Z-107-2-01 | 无线多媒体协同通信模型及性能优化 | 陆建华(清华大学)， 朱文武(微软亚洲研究院)， 张 黔(微软亚洲研究院)， 殷柳国(清华大学)， 陶晓明(清华大学) | 工业和信息化部 | |
| 29 | Z-107-2-02 | 控制系统实时故障检测、分离与估计理论和方法 | 周东华(清华大学)， 叶 昊(清华大学)， 钟麦英(清华大学)， 方崇智(清华大学)， 王桂增(清华大学) | 中国科协 | |
| 30 | Z-107-2-03 | 全生命周期软件体系结构建模理论与方法 | 梅 宏(北京大学)， 黄 罡(北京大学)， 张 路(北京大学)， 张 伟(北京大学) | 教育部 | |
| 31 | Z-107-2-04 | 若干新型非线性电路与系统的基础理论及其应用 | 吕金虎(中国科学院数学与系统科学研究院)， 陈关荣(香港城市大学)， 禹思敏(广东工业大学) | 中国科学院 | |
| 32 | Z-107-2-05 | 神经生物信息模式识别与时空分析 | 胡德文(中国人民解放军国防科学技术大学)， 王正志(中国人民解放军国防科学技术大学)， 周宗潭(中国人民解放军国防科学技术大学)， 徐 昕(中国人民解放军国防科学技术大学)， 刘亚东(中国人民解放军国防科学技术大学) | 总装备部 | |
| 33 | Z-108-2-01 | 氧化锌薄膜微结构与性能调控中的若干基础问题 | 潘 峰(清华大学)， 曾 飞(清华大学)， 宋 成(清华大学)， 杨玉超(清华大学)， 刘雪敬(清华大学) | 教育部 | |
| 34 | Z-108-2-02 | 特征结构导向构筑无机纳米功能材料 | 谢 毅(中国科学技术大学)， 吴长征(中国科学技术大学)， 熊宇杰(中国科学技术大学) | 中国科学院 | |
| 35 | Z-108-2-03 | 新型磁热效应材料的发现和相关科学问题研究 | 沈保根(中国科学院物理研究所)， 胡凤霞(中国科学院物理研究所)， 孙继荣(中国科学院物理研究所)， 张西祥(香港科技大学)， 吴光恒(中国科学院物理研究所) | 中国科学院 | |
| 36 | Z-109-2-01 | 复杂构件不均匀变形机理与精确塑性成形规律 | 杨 合(西北工业大学)， 詹 梅(西北工业大学)， 郭良刚(西北工业大学)， 李宏伟(西北工业大学)， 孙志超(西北工业大学) | 工业和信息化部 | |
| 37 | Z-109-2-02 | 复杂曲面数字化制造的几何推理理论和方法 | 丁 汉(华中科技大学)， 朱向阳(上海交通大学)， 尹周平(华中科技大学)， 朱利民(上海交通大学)， 王 煜(香港中文大学) | 教育部 | |
| 38 | Z-109-2-03 | 多尺度多物理场耦合的复杂系统中流动与传热传质机理研究 | 何雅玲(西安交通大学)， 唐桂华(西安交通大学)， 赵天寿(香港科技大学)， 闵春华(西安交通大学) | 教育部 | |
| 39 | Z-110-2-01 | 低维纳米功能材料与器件原理的物理力学研究 | 郭万林(南京航空航天大学)， 胡海岩(南京航空航天大学)， 张田忠(上海大学)， 郭宇锋(南京航空航天大学)， 王立峰(南京航空航天大学) | 教育部 | |
| 40 | Z-110-2-02 | 压电和电磁机敏材料及结构力学行为的基础研究 | 沈亚鹏(西安交通大学)， 陈常青(西安交通大学)， 田晓耕(西安交通大学)， 王子昆(西安交通大学)， 王 旭(西安交通大学) | 教育部 | |
| 41 | Z-110-2-03 | 非线性应力波传播理论进展及应用 | 王礼立(宁波大学)， 任辉启(总参工程兵科研三所)， 虞吉林(中国科学技术大学)， 周风华(宁波大学)， 吴祥云(总参工程兵科研三所) | 宁波市 | |