如果说从总论文数量上，显示中国学术机构的蓬勃发展形式，但如果分析一下世界顶尖学术期刊上的论文发表情况，又可以看出我们的差距实在是太大了。
从三大世界顶级杂志Cell Nature(不包括子刊)和Science发表论文的数量看，如果只分析长文\编辑资料和Letter的情况,每年的总数量基本保持在4000篇左右，美国学者发表的数量几乎每年都是2400-2500篇，占世界上总数量的60%，而中国学者的发表数量10年总数量还不如美国一年发表的数量。这在中国学者全部论文已经超过美国学者50%的情况下，显然说明我们和美国学者相比存在巨大差距。也要有一点信心，差距大进步也比较大，10年内中国学者在这三大期刊中发表论文的数量也增加了3倍。但是和论文总数量大幅度增加明显不匹配，也就是说总体相对质量是下降了，而不是上升。
中国学者发表论文情况统计
出版年 记录 % of 1092
2012 168 15.385
2010 144 13.187
2011 140 12.821
2009 112 10.256
2008 90 8.242
2005 76 6.960
2007 74 6.777
2004 72 6.593
2006 65 5.952
2001 51 4.670
CNS三大期刊发表论文数量
出版年 记录 % of 48221
2009 4114 8.532
2006 4111 8.525
2005 4101 8.505
2008 4056 8.411
2011 4025 8.347
2002 4009 8.314
2001 3998 8.291
2010 3984 8.262
2007 3960 8.212
2012 3902 8.092
2004 3842 7.967
2003 3827 7.936
各国家排名
国家/地区 记录 % of 48221
1.USA 29560 61.301
2.ENGLAND 6454 13.384
3.GERMANY 4481 9.293
4.FRANCE 2969 6.157
5.CANADA 2477 5.137
6.JAPAN 2353 4.880
7.SWITZERLAND 1868 3.874
8.NETHERLANDS 1590 3.297
9.AUSTRALIA 1555 3.225
10.ITALY 1265 2.623
11.PEOPLES R CHINA 1092 2.265
美国各年度发表论文统计
出版年 记录 % of 29560
2006 2544 8.606
2005 2527 8.549
2001 2508 8.484
2008 2495 8.440
2002 2485 8.407
2009 2475 8.373
2011 2441 8.258
2007 2436 8.241
2004 2391 8.089
2010 2383 8.062