随着商业领域的不良现象向学术领域的不断渗透，随着以量化为主导的学术评价越来越强势，学术期刊受到了双重压力的夹击，由原先的边缘地带被推向风口浪尖，屡屡成为被质疑、被抨击的对象。学术期刊乱象纷纭，存在买卖版面、违规增刊、页数增多、「假刊」、虚假引用等现象，玷污学术风气，令学者深感忧虑乃至愤怒。」不过，把一切责任都推给期刊，显然不公平。（《北京日报》6 月 8 日）
曾经，在期刊上发表论文是一件非常令人羡慕的事情。可现如今，许多人发现除了少部分顶级学术期刊外，只要愿意花钱，从论文选题、写作和发表都有人愿意「代劳」。据中国社科院法学所法治国情调研组发布的《中国学术评价机制调研报告》数据显示，近半数受访者承认曾向核心期刊付费发表论文。
一篇好论文凝聚作者的智慧和汗水，如果报刊发表，应该向作者支付稿酬。而现实是一些人向核心期刊付费发表论文，他们为什么要做这种经济上倒贴、人格上受辱的事？原因很简单，他们要参评某项职称，而在职称评审条件中论文发表情况是硬杠杠，不够条件不能获评。更深层的原因在于，我国学术期刊数量太少，一般作者要想在省级或国家级核心期刊上发表论文，必须花钱买版面，否则几无发表可能。
我国学术期刊较少的原因之一，是刊号受到限制。办一份新的学术刊物门槛较高，而且即使符合条件要拿到刊号也非常不易，这就造成已有学术刊物成为事实上的垄断。因为有太多的人想在学术刊物上发表论文，为此不惜花数千元甚至数万元，很多学术刊物自然不会拒绝送上门的钱，而且还会搞「价高者得」这样的游戏，至于论文质量这一最重要的发表标准则可能被弱化。
我国 2000 年 12 月出台的《关于禁止收费约稿编印图书和期刊的通知》、2002 年 2 月 1 日起施行的《出版管理条例》以及 2005 年 12 月 1 日起施行的《期刊出版管理规定》，都作出了明确的禁止性规定，即任何单位都不得「约稿收费」或「出卖、出租版面」。但规定是一回事，事实是另一回事。倘若不打破现有学术刊物垄断局面，学术期刊收取版面费现象就会一直存在，而且收费会越来越高。
那么，该怎么办？
首先，可以考虑适当放开学术刊物刊号限制，引入市场竞争。放开学术刊物刊号限制并非放任不管，也并非意味着谁都可以办学术刊物。换言之，办一份新的学术刊物，必须达到一定标准。只要申请者达到标准，就可以获得刊号。在放开刊号的同时要加强监管，凡是经营者未能严格遵守相关法律法规的，可以撤销刊号。
其次，建立学术刊物的退出机制。学术刊物存在违法违规行为，强制撤销刊号，这只是其中一种退出方式。对于那些没有违法违规行为但经营不善且无好转迹象的学术刊物，鼓励其主动破产。有进有出，学术市场竞争才会充分，学术刊物才会越办越好。
第三，国家应扶持一些优质学术刊物。学术刊物固然要以学术为重，但没有经济支撑难以为继。学术刊物要生存与发展，采取的措施无非就是开源节流，而这两种方式都不利于其不断提高水平和质量，不利于促进学术繁荣发展。国家应遴选部分学术刊物，给予全额拨款，让刊物免去「柴米油盐」之忧，专注学术，发现和挖掘高质量、高水平的学术文章，以捍卫学术尊严，促进学术研究，推进学术进步。